Как избежать аффилиат-фильтр?

[seoDima2015]

Думаю Вам не стоит волноваться. Сайты признаются аффилиатами, если с помощью них Вы хотите по 1 тематике забить ТОП. Если такой фильтр будет применено, логика следующая:  Оба сайта не будут присутствовать одновременно в ТОП по одинаковым ключевым словам. Будет только 1 из них.

В Вашем случае 1 сайт ориентирован на Опт другой на Розницу. Семантика разная. Главное проведите внутреннюю оптимизацию двух сайтов отдельно. Измените тексты, даже при одинаковой структуре у вас в товарах как минимум будет разная цена. Поменяйте немного описание в карточках товара с учетом ориентира на b2b сегмент. Контакты можете оставить те же.