Куда именно вставить яваскрипт после удаления его из header

[Dayflowers]

Я не пойму в какую папку засунуть скрипт.
Добавлено: 27-03-2014, 15:19:47

Если я вставлю яваскрипт в самый конец папки footer это будет правильно?

[Cergo]

Что бы получить ответ, задайте вопрос по другому.(опешите проблему, более подробно)
Желательно конкретно, с указанием сайта-пациента.